Mientras las otras versiones siguen el arco del Torneo de Fútbol Frontier Internacional, Rayo Celeste introduce una facción secreta: . Vienen del futuro para cambiar el pasado y evitar que Japón gane el torneo. Deberás enfrentarte a ellos en un arco argumental paralelo que añade horas de juego.
La calidad de la localización al español de Inazuma Eleven 3 fue un hito. El equipo de traducción no solo convirtió los textos, sino que mantuvo la esencia de los personajes y adaptó con ingenio los nombres de las técnicas especiales (Hisatsu Técnicas). Quienes crecimos viendo el anime recordamos con cariño gritos como "¡Tornado de Fuego!" o "¡La Mano del Gigante!".
